這是少年少女尋找存在方式的故事。

末日後三千年的時光已逝，方舟城８５２之中，步過末日的少女拔出了那把武士刀，指向了眼前的那個人，即使最後是他，少女眼神中沒有一絲屈服。

一切，一切，都引領到這兒。

一切，一切，卻從那兒開始。

那是舊地球年的千禧前夕。

當時的她抬頭望天，眼中只有蒼輝星河。女孩沒有發現他根本不是在看頭上的點點星宿，清澈的雙瞳卻始終凝視著女孩的雙眼，不知是看著那動人的雙目，還是她雙目中星海的倒影。

但他願意為了眼前這女孩而毀掉世界。

「文明癌，認定——開始肅清！」

末日系列最終作，開幕！